ব্ল্যাক বেঙ্গল: জিনোম সিকোয়েন্স এ যেসব চমকপ্রদ তথ্য পাওয়া যায়

বাংলাদেশের একমাত্র ছাগল প্রজাতি ব্ল্যাক বেঙ্গলের জিনোম সিকোয়েন্স উন্মোচন হয়েছে। কেন এই সিকোয়েন্সের কথা মাথায় এল, কীভাবেই-বা সেটা করা হলো, এ প্রশ্ন বিজ্ঞানপ্রেমীদের মনে আসা স্বাভাবিক। কিন্তু ছাগলের ডিএনএ সিকোয়েন্সিং কীভাবে হলো, সেটা জানতে আমাদের আগে জানা উচিত ডিএনএ কী, কী কী কাজ করে এটা আর কী প্রক্রিয়ায়ই-বা এটাকে সিকোয়েন্সিং করা হলো?

এসব প্রশ্নের জবাব আগের একাধিক লেখায় এসেছে। তাই এই বিষয় নিয়ে আমরা আলোচনা করব না। তার চেয়ে বরং সিকোয়েন্সিংয়ের সঙ্গে জড়িত দুটি গুরত্বপূর্ণ বিষয় অ্যাসেম্বলিং ও অ্যাটেনশন সম্পর্কে জানার চেষ্টা করি। তারপর ব্ল্যাক বেঙ্গলের গল্পে যাব।

বায়োইনফরমেটিকসের পরিভাষায় সিকোয়েন্স অ্যাসেম্বলি বলতে অপেক্ষাকৃত লম্বা ডিএনএ সূত্রকের খণ্ডাংশগুলোকে সারিবদ্ধভাবে সাজিয়ে পরস্পরের সঙ্গে যুক্ত করে মূল ডিএনএ সূত্রকটি পুনরুদ্ধার করার প্রক্রিয়াকে বোঝায়। আধুনিক ডিএনএ সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তিগুলো পুরো ডিএনএ সূত্রককে একবারে পড়তে পারে না, কিন্তু প্রযুক্তিভেদে অপেক্ষাকৃত ছোট ২০-৩০ হাজার বেস পেয়ারের মধ্যে খণ্ডাংশগুলোকে পড়তে পারে।

ব্ল্যাক বেঙ্গল ছাগলের জিনোম

ব্ল্যাক বেঙ্গল ছাগলের জীবন জিনোম সিকোয়েন্সিং করা হয়েছে চট্টগ্রাম ভেটেরিনারি ও অ্যানিমেল সায়েন্স বিশ্ববিদ্যালয়ে (সিভাসু)। এর আগে বাংলাদেশে পাট ও ইলিশের জিনোম সিকোয়েন্স করা হয়েছে, কিন্তু ব্ল্যাক বেঙ্গল ছাগলের জিনোমের আকারই এদের মধ্যে সবচেয়ে বড়।

চট্টগ্রামের হাটহাজারি সরকারি ছাগলের খামার থেকে সংগৃহীত ব্ল্যাক বেঙ্গল ছাগলের রক্ত থেকে ডিএনএ সংগ্রহ করা হয়। তারপর সেটা বিশ্লেষণ করে দেখা যায়, এর জিনোমের দৈর্ঘ্য প্রায় ৩ দশমিক শূন্য ৪ গিগাবাইট। এর মধ্যে প্রায় ৩১ দশমিক ৮৫ শতাংশ হলো রিপিট। ২৯ জোড়া ক্রোমোজোমের মধ্যে ২৬ হাজার ৪৫৮ জিন অনুমান করা হলেও এর মধ্যে ১২ হাজার ৫৮৯ জিনের স্ট্রাকচার অ্যানোটেশন করা হয়। কমপক্ষে একটা জিন অনটোলজি টার্ম পাওয়া যায় ৮ হাজার ১৭৩ জিনের মধ্যে। সম্প্রতি এই গবেষণা প্রকল্পটি বিখ্যাত সায়েন্টিফিক জার্নাল বিএমসিতে প্রকাশিত হয়েছে।

সব ডেটাবেইস এনসিবিআইতে সংরক্ষিত আছে। ডেটা অ্যানালাইসিসের জন্য সিভাসুতে ১২৮ জিবি র‍্যান্ডম ক্ষমতাসম্পন্ন একটা কম্পিউটার স্থাপন করা হয় এবং ব্যবহার করা হয় বাংলাদেশ বিশ্ববিদ্যালয় মঞ্জুরি কমিশনের উচ্চক্ষমতাসম্পন্ন সার্ভার। গবেষণার অধিকাংশ বাংলাদেশ থেকে করা হয়েছে এবং কিছু অংশের জন্য আরও উচ্চক্ষমতাসম্পন্ন সার্ভারের দরকার হয়। সেটি আবদুল বাতেন অস্ট্রেলিয়ার সাউদার্ন ক্রস বিশ্ববিদ্যালয়ের উচ্চক্ষমতাসম্পন্ন সার্ভার ব্যবহার করে সম্পন্ন করেন। ২০২২ সালের মাঝামাঝি সময়ে এ বিষয়ে গবেষণা ফলাফল বিখ্যাত স্প্রিঞ্জার নেচার প্রেস থেকে প্রকাশিত বিজ্ঞান জার্নাল বিএমসি রিসার্চ নোটস–এ প্রকাশিত হয়েছে।

গবেষণা প্রকল্পটির সার্বক্ষণিক তত্ত্বাবধানে ছিলেন নিউজিল্যান্ডপ্রবাসী বাংলাদেশি বিজ্ঞানী আবদুল বাতেন এবং বাংলাদেশ প্রকৌশল ও প্রযুক্তি বিশ্ববিদ্যালয়ের কম্পিউটারবিজ্ঞান ও প্রকৌশল বিভাগের সহকারী অধ্যাপক আতিফ হাসান রহমান। এ ছাড়া সহযোগিতায় ছিলেন অস্ট্রেলিয়ার লা ট্রোব বিশ্ববিদ্যালয়ের মাইকেল স্টিয়ার, সিভাসুর জেনিটিকস ও অ্যানিমেল ব্রিডিং বিভাগের অধ্যাপক মো. কবিরুল ইসলাম খান এবং অধ্যাপক গউজ মিয়া এবং সিভাসুর গবেষণা ও সম্প্রসারণ পরিচালক মোহাম্মদ আলমগীর হোসেন। সিভাসুর উপাচার্য গৌতম বুদ্ধ দাশের একান্ত আগ্রহ ও সহযোগিতায় গবেষণাটি আলোর মুখ দেখে। সিভাসু ও বুয়েট ছাড়াও চট্টগ্রাম বিশ্ববিদ্যালয়, ইউএসটিসি, প্রিমিয়ার বিশ্ববিদ্যালয়, এশিয়ান ইউনিভার্সিটি ফর উইমেনের গবেষণার সঙ্গে সম্পৃক্ত ছিলেন।

বাংলাদেশের গ্রামের সাধারণ মানুষ এ ছাগল পালন করলেও অতি লাভের আশায় অন্য জাতের ছাগলের সঙ্গে এর সংকরায়ণও খুব একটা করে না। ফলে বিশ্বের হাতে গোনা যে ৪ থেকে ৫টি ছাগলের জাতের এখনো সংকরায়ণ হয়নি, স্বতন্ত্র জাত হিসেবে টিকে আছে, তার অন্যতম এই ব্ল্যাক বেঙ্গল। নিজস্ব বৈশিষ্ট্য নিয়ে এই জাত টিকিয়ে রেখেছে গ্রামের সাধারণ মানুষ। প্রাণিসম্পদ অধিদপ্তরের হিসাবে, এ মুহূর্তে আড়াই কোটির বেশি ছাগল আছে বাংলাদেশে।

এর ৯৫ শতাংশই ব্ল্যাক বেঙ্গল। দেশের প্রায় ১ কোটি লোক ছাগল পালন করে। একক কোনো প্রাণী পালনের ক্ষেত্রে এটা একটা রেকর্ড। বাংলাদেশের এই ছাগলের সদ্যোজাত বাচ্চার মৃত্যুহার কম। খুব দ্রুত প্রজননক্ষম হয় বলে এই জাতের মাদি ছাগল বছরে দুবার গর্ভধারণ করতে পারে এবং প্রতিবার ৩ থেকে ৪টি বাচ্চা প্রসব করে। তা ছাড়া কম সময়ে পরিবেশের সঙ্গে খাপ খাওয়াতে পারে বলে এই জাতের ছাগলের রোগ প্রতিরোধক্ষমতাও বেশি। তাই অন্য জাতগুলোর তুলনায় এই জাতের ছাগলের সংখ্যা সবচেয়ে দ্রুত বাড়ছে। এর আরেকটি গুরুত্বপূর্ণ বৈশিষ্ট্য, এটি পালন করতে বড় চারণভূমি লাগে না।

বাড়ির উঠান বা রান্নাঘরের পাশের ছোট্ট স্থানেও এরা দিব্যি বেড়ে ওঠে। তবে এফএওর গবেষণায় বলা হয়েছে, ব্ল্যাক বেঙ্গল ছাগলের দুর্বল দিক হলো এর দৈহিক গঠন ও দুধের পরিমাণ অন্যান্য ছাগলের চেয়ে কম। ছাগলের জীবনরহস্য উন্মোচনের মাধ্যমে ভবিষ্যতে এর দুর্বল বৈশিষ্ট্যগুলো দূর করে আরও উন্নত প্রজাতির ব্ল্যাক বেঙ্গল জাত তৈরি করা যাবে, যা বাংলাদেশের আর্থসামাজিক উন্নয়নে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রাখবে।